Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tm6sf1P58749 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tm6sf1P58749 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tm6sf1P58749 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tm6sf1P58749 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms