Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpdl3bP58242 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpdl3bP58242 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms