Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lim2P56563 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lim2P56563 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lim2P56563 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lim2P56563 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lim2P56563 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lim2P56563 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lim2P56563 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lim2P56563 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lim2P56563 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lim2P56563 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lim2P56563 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lim2P56563 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lim2P56563 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lim2P56563 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lim2P56563 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms