Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5g3P56384 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5g3P56384 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms