Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nub1P54729 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nub1P54729 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nub1P54729 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nub1P54729 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nub1P54729 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nub1P54729 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nub1P54729 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nub1P54729 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nub1P54729 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms