Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2e3P52483 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ube2e3P52483 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2e3P52483 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms