Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pold1P52431 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pold1P52431 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pold1P52431 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pold1P52431 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pold1P52431 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold1P52431 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pold1P52431 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold1P52431 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold1P52431 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold1P52431 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold1P52431 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold1P52431 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold1P52431 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold1P52431 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms