Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApodP51910 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApodP51910 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApodP51910 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApodP51910 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ApodP51910 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ApodP51910 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApodP51910 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApodP51910 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApodP51910 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApodP51910 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ApodP51910 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApodP51910 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ApodP51910 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApodP51910 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ApodP51910 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ApodP51910 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApodP51910 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ApodP51910 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ApodP51910 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ApodP51910 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ApodP51910 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ApodP51910 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ApodP51910 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ApodP51910 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ApodP51910 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ApodP51910 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ApodP51910 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ApodP51910 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ApodP51910 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ApodP51910 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ApodP51910 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ApodP51910 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApodP51910 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApodP51910 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApodP51910 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApodP51910 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApodP51910 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApodP51910 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ApodP51910 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApodP51910 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApodP51910 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApodP51910 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApodP51910 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApodP51910 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApodP51910 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ApodP51910 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApodP51910 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApodP51910 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApodP51910 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApodP51910 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApodP51910 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ApodP51910 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ApodP51910 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApodP51910 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApodP51910 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApodP51910 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApodP51910 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApodP51910 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApodP51910 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApodP51910 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApodP51910 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApodP51910 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApodP51910 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApodP51910 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApodP51910 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ApodP51910 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApodP51910 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApodP51910 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApodP51910 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApodP51910 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApodP51910 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApodP51910 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApodP51910 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApodP51910 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApodP51910 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms