Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SftpdP50404 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SftpdP50404 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SftpdP50404 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpdP50404 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpdP50404 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpdP50404 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpdP50404 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpdP50404 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SftpdP50404 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms