Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbp3P49194 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbp3P49194 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbp3P49194 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms