Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf4P47741 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf4P47741 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf4P47741 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms