Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsfP46460 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsfP46460 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NsfP46460 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsfP46460 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsfP46460 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsfP46460 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsfP46460 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsfP46460 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsfP46460 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsfP46460 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsfP46460 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsfP46460 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsfP46460 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsfP46460 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NsfP46460 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsfP46460 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NsfP46460 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NsfP46460 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsfP46460 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsfP46460 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsfP46460 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsfP46460 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms