Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlx1P43345 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tlx1P43345 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlx1P43345 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlx1P43345 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlx1P43345 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlx1P43345 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlx1P43345 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlx1P43345 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlx1P43345 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms