Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox15P43267 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox15P43267 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox15P43267 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms