Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc19a1P41438 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc19a1P41438 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc19a1P41438 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms