Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ThpoP40226 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ThpoP40226 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ThpoP40226 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ThpoP40226 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ThpoP40226 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ThpoP40226 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ThpoP40226 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ThpoP40226 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ThpoP40226 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ThpoP40226 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ThpoP40226 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ThpoP40226 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms