Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp12P34960 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp12P34960 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp12P34960 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp12P34960 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp12P34960 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mmp12P34960 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mmp12P34960 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mmp12P34960 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms