Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnar1P33896 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnar1P33896 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnar1P33896 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnar1P33896 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms