Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TbpP29037 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TbpP29037 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TbpP29037 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TbpP29037 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TbpP29037 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TbpP29037 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TbpP29037 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TbpP29037 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TbpP29037 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TbpP29037 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TbpP29037 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TbpP29037 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TbpP29037 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TbpP29037 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TbpP29037 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TbpP29037 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TbpP29037 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TbpP29037 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TbpP29037 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TbpP29037 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TbpP29037 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TbpP29037 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TbpP29037 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TbpP29037 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TbpP29037 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TbpP29037 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TbpP29037 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TbpP29037 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TbpP29037 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TbpP29037 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TbpP29037 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TbpP29037 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TbpP29037 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TbpP29037 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TbpP29037 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TbpP29037 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TbpP29037 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TbpP29037 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TbpP29037 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TbpP29037 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TbpP29037 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TbpP29037 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TbpP29037 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TbpP29037 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TbpP29037 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TbpP29037 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TbpP29037 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TbpP29037 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TbpP29037 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TbpP29037 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TbpP29037 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TbpP29037 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TbpP29037 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TbpP29037 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TbpP29037 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TbpP29037 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TbpP29037 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TbpP29037 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TbpP29037 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TbpP29037 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TbpP29037 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TbpP29037 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TbpP29037 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TbpP29037 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TbpP29037 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TbpP29037 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TbpP29037 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TbpP29037 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TbpP29037 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TbpP29037 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TbpP29037 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TbpP29037 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TbpP29037 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TbpP29037 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TbpP29037 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TbpP29037 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TbpP29037 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TbpP29037 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms