Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Etv4P28322 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Etv4P28322 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Etv4P28322 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv4P28322 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv4P28322 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv4P28322 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Etv4P28322 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms