Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-DMaP28078 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-DMaP28078 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms