Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af2P26369 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af2P26369 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af2P26369 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af2P26369 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af2P26369 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2af2P26369 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af2P26369 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af2P26369 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af2P26369 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af2P26369 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af2P26369 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms