Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myod1P10085 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myod1P10085 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myod1P10085 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms