Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp1P08042 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp1P08042 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp1P08042 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp1P08042 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms