Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd4P06332 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd4P06332 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd4P06332 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd4P06332 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd4P06332 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd4P06332 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd4P06332 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd4P06332 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd4P06332 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd4P06332 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd4P06332 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms