Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01673 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01673 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01673 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01673 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01673 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01673 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01673 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01673 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01673 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01673 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01673 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01673 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01673 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01673 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01673 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01673 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01673 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01673 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01673 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01673 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01673 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01673 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01673 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01673 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01673 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01673 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01673 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01673 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01673 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01673 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01673 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01673 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01673 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01673 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01673 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01673 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01673 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01673 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01673 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01673 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01673 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01673 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01673 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01673 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01673 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01673 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01673 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01673 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01673 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01673 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01673 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01673 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01673 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01673 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01673 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01673 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01673 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01673 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01673 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01673 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01673 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01673 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01673 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01673 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms