Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Robo1O89026 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Robo1O89026 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Robo1O89026 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Robo1O89026 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Robo1O89026 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Robo1O89026 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Robo1O89026 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Robo1O89026 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Robo1O89026 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Robo1O89026 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Robo1O89026 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Robo1O89026 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Robo1O89026 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Robo1O89026 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Robo1O89026 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Robo1O89026 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms