Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a3O88561 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc27a3O88561 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc27a3O88561 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms