Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IkbkbO88351 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IkbkbO88351 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IkbkbO88351 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IkbkbO88351 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IkbkbO88351 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IkbkbO88351 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IkbkbO88351 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms