Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra6O70491 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stra6O70491 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stra6O70491 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stra6O70491 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra6O70491 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra6O70491 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stra6O70491 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Stra6O70491 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stra6O70491 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stra6O70491 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms