Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxq1O70220 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Foxq1O70220 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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