Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap1O55125 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms