Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole2O54956 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole2O54956 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole2O54956 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole2O54956 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole2O54956 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole2O54956 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole2O54956 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole2O54956 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole2O54956 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole2O54956 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole2O54956 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms