Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DffaO54786 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DffaO54786 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DffaO54786 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DffaO54786 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DffaO54786 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DffaO54786 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DffaO54786 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DffaO54786 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DffaO54786 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DffaO54786 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DffaO54786 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DffaO54786 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DffaO54786 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DffaO54786 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DffaO54786 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DffaO54786 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DffaO54786 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DffaO54786 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DffaO54786 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DffaO54786 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DffaO54786 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DffaO54786 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DffaO54786 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DffaO54786 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DffaO54786 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DffaO54786 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DffaO54786 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DffaO54786 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DffaO54786 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DffaO54786 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DffaO54786 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DffaO54786 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DffaO54786 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DffaO54786 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DffaO54786 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DffaO54786 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DffaO54786 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DffaO54786 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DffaO54786 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DffaO54786 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DffaO54786 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DffaO54786 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DffaO54786 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DffaO54786 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DffaO54786 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DffaO54786 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DffaO54786 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DffaO54786 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DffaO54786 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DffaO54786 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DffaO54786 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DffaO54786 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DffaO54786 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DffaO54786 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DffaO54786 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DffaO54786 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DffaO54786 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DffaO54786 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DffaO54786 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DffaO54786 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DffaO54786 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DffaO54786 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms