Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NudcO35685 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NudcO35685 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NudcO35685 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NudcO35685 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NudcO35685 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NudcO35685 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NudcO35685 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NudcO35685 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NudcO35685 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NudcO35685 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NudcO35685 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NudcO35685 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NudcO35685 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NudcO35685 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NudcO35685 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NudcO35685 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NudcO35685 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NudcO35685 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NudcO35685 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NudcO35685 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NudcO35685 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NudcO35685 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NudcO35685 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NudcO35685 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NudcO35685 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NudcO35685 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NudcO35685 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NudcO35685 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NudcO35685 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NudcO35685 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NudcO35685 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NudcO35685 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NudcO35685 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NudcO35685 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NudcO35685 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NudcO35685 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NudcO35685 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NudcO35685 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NudcO35685 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NudcO35685 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NudcO35685 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NudcO35685 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NudcO35685 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NudcO35685 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NudcO35685 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NudcO35685 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NudcO35685 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NudcO35685 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NudcO35685 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NudcO35685 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NudcO35685 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NudcO35685 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NudcO35685 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NudcO35685 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NudcO35685 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NudcO35685 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NudcO35685 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NudcO35685 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NudcO35685 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NudcO35685 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NudcO35685 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NudcO35685 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NudcO35685 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NudcO35685 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NudcO35685 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NudcO35685 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NudcO35685 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NudcO35685 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NudcO35685 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NudcO35685 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NudcO35685 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NudcO35685 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NudcO35685 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NudcO35685 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NudcO35685 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NudcO35685 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NudcO35685 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NudcO35685 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NudcO35685 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NudcO35685 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NudcO35685 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NudcO35685 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NudcO35685 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NudcO35685 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NudcO35685 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NudcO35685 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NudcO35685 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NudcO35685 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NudcO35685 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NudcO35685 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NudcO35685 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NudcO35685 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NudcO35685 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NudcO35685 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NudcO35685 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NudcO35685 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NudcO35685 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NudcO35685 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NudcO35685 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms