Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf11aO35305 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf11aO35305 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf11aO35305 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf11aO35305 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf11aO35305 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf11aO35305 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf11aO35305 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf11aO35305 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnfrsf11aO35305 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf11aO35305 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf11aO35305 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.6 ms