Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc18a3O35304 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc18a3O35304 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 938.2 ms