Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Pkd2O35245 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC31,2■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,2■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Pkd2O35245 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31,14■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31,14■■■□□ 2,58
Pkd2O35245 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Pkd2O35245 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,3 ms