Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pitx3O35160 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitx3O35160 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms