Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4dO09126 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms