Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dctn1O08788 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dctn1O08788 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms