Protein–RNA interactions for Protein: O08739

Ampd3, AMP deaminase 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd3O08739 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ampd3O08739 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ampd3O08739 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ampd3O08739 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms