Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3aO08665 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema3aO08665 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema3aO08665 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms