Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d1O08532 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms