Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20878L7N244 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20878L7N244 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20878L7N244 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20878L7N244 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20878L7N244 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20878L7N244 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20878L7N244 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20878L7N244 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20878L7N244 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms