Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3685J3QPP2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3685J3QPP2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3685J3QPP2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms