Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8298J3QPI0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8298J3QPI0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms