Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3415J3QMS8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3415J3QMS8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3415J3QMS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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