Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sclt1G5E861 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms