Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SprtnG3X912 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SprtnG3X912 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SprtnG3X912 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms